單細(xì)胞擴(kuò)增實(shí)驗(yàn)對操作細(xì)節(jié)要求較高,實(shí)驗(yàn)結(jié)果會(huì)受到樣本處理、體系配制等多個(gè)環(huán)節(jié)影響。按照試劑盒配套要求執(zhí)行標(biāo)準(zhǔn)化操作,能夠減少實(shí)驗(yàn)過程中的人為偏差,保障實(shí)驗(yàn)過程穩(wěn)定,獲取可用的實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)。整個(gè)實(shí)驗(yàn)主要分為樣本前期準(zhǔn)備、樣本裂解處理、擴(kuò)增反應(yīng)體系配制、上機(jī)反應(yīng)等環(huán)節(jié),其中樣本裂解與反應(yīng)體系配制屬于實(shí)驗(yàn)關(guān)鍵步驟,需要落實(shí)對應(yīng)的實(shí)操規(guī)范。
開展實(shí)驗(yàn)之前,需要完成前期準(zhǔn)備工作。實(shí)驗(yàn)人員需要做好個(gè)人防護(hù),穿戴實(shí)驗(yàn)防護(hù)用品,對實(shí)驗(yàn)操作臺(tái)進(jìn)行清潔處理。實(shí)驗(yàn)所用的移液器具、耗材需要確認(rèn)無核酸污染,耗材開封后盡量一次性使用,避免反復(fù)取用造成交叉污染。試劑盒內(nèi)各類組分取出后,放置在合適環(huán)境下進(jìn)行融化,融化過程中避免劇烈搖晃。全部試劑融化完成之后,輕柔顛倒混勻,通過低速離心將管壁附著的液體收集到管底,再放置于冰上待用。實(shí)驗(yàn)過程盡量在低溫環(huán)境下開展,減少試劑組分發(fā)生降解。
樣本裂解是單細(xì)胞擴(kuò)增實(shí)驗(yàn)的前置步驟,直接關(guān)系后續(xù)擴(kuò)增效果。實(shí)驗(yàn)操作需要在潔凈的操作空間內(nèi)完成,避免環(huán)境中的外源核酸進(jìn)入樣本體系。待處理的單細(xì)胞樣本需要保持狀態(tài)穩(wěn)定,操作過程盡量縮短樣本在室溫下暴露的時(shí)間。將單細(xì)胞樣本轉(zhuǎn)移至裂解反應(yīng)管內(nèi),操作時(shí)注意避免樣本出現(xiàn)丟失,同時(shí)防止樣本管內(nèi)壁沾染多余樣本。
加入裂解相關(guān)試劑時(shí),移液操作要平穩(wěn),試劑需要精準(zhǔn)加到反應(yīng)管底部,不要掛在管壁位置。試劑添加完成之后,輕柔吹打混勻樣本與裂解試劑,混勻動(dòng)作不宜用力過猛,防止產(chǎn)生大量氣泡。混勻結(jié)束后,做好短暫離心,使管內(nèi)全部液體匯集到管底。按照試劑盒規(guī)定的條件開展裂解孵育,孵育過程中保持環(huán)境條件穩(wěn)定,不要隨意挪動(dòng)反應(yīng)管。裂解結(jié)束之后,反應(yīng)產(chǎn)物可以短暫置于低溫環(huán)境暫存,不建議長時(shí)間放置,需要盡快進(jìn)入后續(xù)體系配制環(huán)節(jié)。裂解操作過程中,要區(qū)分樣本管與陰性對照管,做好標(biāo)記,避免樣本混淆。
擴(kuò)增反應(yīng)體系配制需要遵循分區(qū)操作原則,試劑配制區(qū)域和樣本處理區(qū)域分開,降低樣本之間交叉污染的可能性。配制體系前,再次核對試劑盒各組分狀態(tài),確認(rèn)試劑沒有出現(xiàn)分層、沉淀等異常情況。配制體系時(shí),建議在冰盒上進(jìn)行操作,維持試劑低溫狀態(tài)。
體系配制優(yōu)先配制預(yù)混液,將試劑盒內(nèi)對應(yīng)的各類試劑按照操作說明混合在一起。配制預(yù)混液的時(shí)候,移液要做到動(dòng)作輕柔,吸取試劑盡量避免產(chǎn)生氣泡。每加入一種試劑,完成移液之后可以輕輕吹打混勻,全部試劑添加完畢后,輕柔顛倒混勻預(yù)混液,之后進(jìn)行短暫離心,把管壁上殘留液體收集至管底。預(yù)混液配制完成之后,按照實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì),分裝到各個(gè)反應(yīng)管當(dāng)中。
向反應(yīng)管內(nèi)加入裂解后的樣本產(chǎn)物時(shí),移液槍頭需要更換,避免不同樣本之間發(fā)生交叉污染。樣本加入反應(yīng)管后,輕柔吹打混勻管內(nèi)液體,混勻之后進(jìn)行離心,使全部液體匯集到管底。配制完成的反應(yīng)體系,需要檢查管內(nèi)是否存在氣泡,氣泡會(huì)干擾后續(xù)反應(yīng)進(jìn)程,如果出現(xiàn)氣泡,可以通過低速離心消除。
配制體系的全過程需要做好樣本記錄,對每一個(gè)反應(yīng)管做好清晰標(biāo)識(shí),記錄樣本編號(hào)、處理時(shí)間等信息。配制結(jié)束后,盡快將反應(yīng)管放置到儀器當(dāng)中啟動(dòng)擴(kuò)增反應(yīng),減少體系在室溫下停留的時(shí)長。實(shí)驗(yàn)過程中,需要同步設(shè)置對照樣本,對照樣本同樣按照相同的操作流程完成體系配制,用于判斷實(shí)驗(yàn)過程是否存在異常。
實(shí)驗(yàn)結(jié)束之后,需要對操作臺(tái)、移液器具進(jìn)行清潔。剩余試劑按照試劑盒說明進(jìn)行保存,耗材按照實(shí)驗(yàn)廢棄物相關(guān)要求處理。操作過程中如果出現(xiàn)試劑灑落、樣本管破損等情況,需要及時(shí)對區(qū)域進(jìn)行清潔處理,防止污染擴(kuò)散。
在實(shí)際實(shí)操當(dāng)中,需要留意一些常見問題。裂解環(huán)節(jié)如果混勻力度過大,容易造成樣本損傷;體系配制時(shí)如果產(chǎn)生較多氣泡,會(huì)影響反應(yīng)進(jìn)行。操作時(shí)盡量保持動(dòng)作連貫,減少不必要的反復(fù)開蓋,降低環(huán)境污染物進(jìn)入反應(yīng)體系的概率。
標(biāo)準(zhǔn)化的樣本裂解與擴(kuò)增體系配制,是單細(xì)胞擴(kuò)增實(shí)驗(yàn)?zāi)軌蝽樌_展的基礎(chǔ)。嚴(yán)格遵循操作流程,把控每一步的操作細(xì)節(jié),能夠降低實(shí)驗(yàn)干擾因素,保障實(shí)驗(yàn)過程的重復(fù)性,為后續(xù)的數(shù)據(jù)分析提供可靠的實(shí)驗(yàn)基礎(chǔ)。